Expressed sequence Tag-1 برای تشخیص کدام مورد، به کار می‌رود؟

(کنکور وزارت علوم 93 رشته بیوتکنولوژی میکروبی)

1) اینترون‌ها                                          2) ژن‌های RNA ریبوزومی

3) میکروساتلایت‌ها                                   4) ژن‌هایی که پروتئین‌ها را کد می‌کنند

2-یافتن یک انطباق مناسب بدون در نظر گرفتن اندازه اینترون‌ها، کاربرد کدام ابزار است؟

(آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 92-91)

1) spidey

2) splign

3)cn3D

4)JGI

3-کدام ابزار برای محاسبه انطباق‌های توالی‌های پیرایش شده و همچنین بین cDNA و ژنوم استفاده می‌شود؟

(آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 92-91)

1)Cn3D

2)splign

3) BioMart

4)UniGene DDD

4-کدام ابزار برای مقایسه پروفایل‌های محاسبه شده بین ژن‌ها در مجموعه کتابخانه‌های cDNA کاربرد دارد؟

(آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 92-91)

1)UniGene DDD

2)OMSSA

3)BLAST

4) COG

5-کدام ابزار مانع از پذیرش ژن‌های کاذب و پاراگوگ‌های نزدیک به توالی موردنظر می‌شود؟

(آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 92-91)

1)Spidey

2) ORF

3)Splign

4)IMG

6-کدامیک بیانگر کاربرد Splign است؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 92-91)

1) یافتن یک انطباق مناسب بدون در نظر گرفتن اندازه اینترون‌ها

2) محاسبه انطباق‌های توالی‌های پیرایش شده و نیز بین cDNA و ژنوم

3) مقایسه پروفایل‌های محاسبه شده بیان ژن‌ها

4) مقایسه توالی موردنظر نوکلئوتیدی با بانک اطلاعاتی توالی پروتئین

7-کدامیک سایتی برای جستجوی ژن‌های RNA به حساب می‌آید؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 92-91)

1) Rfam

2)FTP

3) GNN

4)UPR

8-کدام ابزار برای مقایسه پروفایل‌های محاسبه شده بیان ژن‌ها در مجموعه کتابخانه‌های cDNA کاربرد دارد؟

(آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 91-90)

1)BLAST

2) COG

3)uniGene DDD

4) OMSSA

68-سوالات فصل پنجم

9-کدامیک به عنوان محل ذخیره‌سازی عمومی برای طیف وسیعی از داده‌هاست که از آزمایش‌های یا مقیاس بالا به دست می‌آیند؟

(آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 90-89)

1)Splign

2)Blink

3) GEO

4)Cn3D

DNA microarray-10 کدامیک را آنالیز می‌کند؟ (سوالات آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 89-88)

1)tRNA,mRNA

2)mRNA,Genomic DNA

3)Genomic DNA,tRNA

4)tRNA

11-مفهوم Transcriptomics شامل: (دکتری تخصصی (D) زیست فناوری پزشکی سال 96-95)

1) mRNAs

2) non- coding RNAs

3) Small RNAs

4) همه موارد فوق

12-اهمیت بررسی‌های Co-expression genes بیش‌تر در:

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست‌فناوری پزشکی سال 97-96)

1) Protein interaction networks

2) Gene regulation networks

3) Metabolite network

4) موارد 2 و 3

13-کدام‌یک در NCBI به عنوان یک پایگاه داده‌ای Transcriptome محسوب می‌شود؟

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست‌فناوری پزشکی سال 97-96)

1) WGS

2) TSA

3) INSDC

4) Gene

14-برای کشف توالی‌های پروتئینی انسانی با عملکرد ناشناخته استفاده از کدام‌یک از داده‌های زیر می‌تواند مفیدتر باشد؟

(آزمون دکتری تخصصی (Ph.D) رشته زیست پزشکی سامانه‌ای سال 97-96)

1) داده‌های EST

2) داده‌های ژنومی

3) کلیه داده‌های موجود در GenBank

4) کلیه داده‌های موجود در Ensembl

69-ترنسکریپتومیکس