1-در صورتی که هدف مطالعه‌ای تعیین پروموتر یک ژن یوکاریوتیک باشد جهت افزایش اختصاصیت پیش‌بینی، کدام گزینه صحیح است؟

(دکتری بیوتکنولوژی پزشکی سال 1393)

1) تلفیق توالی Shine-Dalgarno و دیگر سیگنال‌های پروموتر

2) تلفیق جزایر CPG و دیگر سیگنال‌های پروموتر

3) تلفیق جزایر CPG و توالی Shine- Dalgarno

4) استفاده از روش Phylogenetic foot printing

2-انجام کدام‌یک از پروژه‌های ذیل با استفاده از Next generation sequencing مناسب‌تر است؟

(دکتری تخصصی زیست فناوری پزشکی 95-94)

1) تعیین یک موتاسیون Missense در یک تومور

2) جستجوی Transcriptome در یک نمونه توموری

3) تعیین ژنوتیپ ده نمونه DNA ژنومی برای یک SNP شناخته شده

4) همه موارد فوق

3-به منظور تعیین توالی ژنوم یوکاریوت‌ها، کدام‌یک از روش‌های ذیل ارجح است؟

(دکتر تخصصی زیست فناوری پزشکی 95-94)

1) Shotgun

2) Hierarchial

3) Microrray

4) Sanger

4-در نقشه‌های ژنتیکی یا Genetic maps کدام‌یک از موارد ذیل تعیین می‌گردد؟

(دکتری تخصصی زیست فناوری پزشکی 95-94)

1) مکان شاخص‌های قابل تشخیص در روی یک DNA ژنومی صرف‌نظر از الگوهای توارث

2) الگوی باندها در کروموزوم‌های رنگ‌آمیزی شده

3) فاصله بین مارکرهای ژنتیکی به‌طور مستقیم به‌صورت کیلوباز یا مگاباز

4) موقعیت تقریبی مارکرهای ژنتیکی که توارث آن‌ها قابل پیگیری است.

5-به منظور انجام Genetic Finger Printing تعیین کدام‌یک از گزینه‌های ذیل ضروری است؟

(دکتری تخصصی زیست فناوری پزشکی 95-94)

1) Genetic Maps

2) Physical Maps

3) Cytologic Maps

4) Genome Annotation

6-منظور از Genome Annotation چیست؟ (دکتری تخصصی زیست فناوری پزشکی 95-94)

1) تجمیع توالی‌های کوتاه به‌دست آمده طی تعیین توالی ژنوم

2) تعیین موقعیت تقریبی مارکرهای ژنتیکی روی یک کروموزوم

3) تعیین مکان شاخص‌های قابل تشخیص در روی یک DNA ژنومی

4) پیش‌بینی‌ها برای تشخیص ژن و وظیفه عملکردی آن

78-سوالات فصل هفتم

7-کدام‌یک از موارد ذیل در پیش‌بینی ژن‌های پروکاریوتها کاربرد کم‌تری دارد؟

(دکتری تخصصی زیست فناوری پزشکی 95-94)

1) مدل‌های مبتنی بر Hidden Markov

2) روش‌های مبتنی بر رونویسی

3) روش‌های مبتنی بر Homology

4) Ab-initio gene prediction

8-کدام‌یک از موارد ذیل به عنوان یکی از راهکارهای با توان عملیاتی بالا (High Throught Approach) برای بررسی ژنومیکس عملکردی محسوب نمی‌گردد؟

(دکتری بیوتکنولوژی پزشکی سال 1393)

1) DNA microarray

2) Threading

3) SAGE

4) NGS

9-به منظور شناسائی ژن‌های افقی منتقل شده بین موجودات مختلف کدام‌یک از روش‌های بیوانفورماتیکی ذیل توصیه می‌گردد؟

(دکتری بیوتکنولوژی پزشکی سال 1392)

1) انطباق توالی چندتائی ژن‌ها                        2) ژنومیکس مقایسه‌ای

3) انطباق توالی دوتائی ژن‌ها                          4) ترسیم نمودار نقطه‌ای

10-به منظور تعیین ژن‌های دخیل در مسیرهای متابولیکی کلیدی چه روش بیوانفورماتیکی بیش‌تر توصیه می‌گردد؟

(دکتری بیوتکنولوژی پزشکی سال 1392)

1) یافتن ژنوم حداقل                                   2) انطباق توالی چندتائی ژن‌ها

3) بررسی اطلاعات ریزآرایه ها                      4) مطالعات فیلوژنتیکی

11-کدام بانک اطلاعاتی دلالت بر اجتماعی از توالی‌های Shotgun کل ژنوم دارد؟

(آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 91-90)

1)WGS

2)dbSTS

3)Month

4)est

12-کدام گزینه معرف WGS است؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 90-89)

1) بانک اطلاعاتی توالی‌های GenBank است

2) ژنوم‌های کامل و کروموزوم‌های کامل از پروژه توالی مرجع NCBl است

3)اجتماعی از توالی‌های Shotgun کل ژنوم است

4) توالی نوکلئوتیدی از نمونه‌های محیطی است

13-کدام بانک اطلاعاتی با بانک اطلاعاتی Chromosome همپوشانی دارد؟

(آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 90-89)

1)Refseq-mrna

2)est

3)Refseq genomic

4)WGS

14-کدام‌یک جزء آنتولوژی‌های ژنوم محسوب نمی‌شود؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 90-89)

1)Molecular Function

2)Evidence Code

3) Biological Process

4) Cellular Component

15-کدام‌یک روش محاسباتی برای تشخیص محل STS ها درون یک توالی DNA است؟

(آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 90-89)

1)Spidey

2) Taxplot

3)e-PCR

4)Cn3D

16-کدام گزینه منبع جهانی اطلاعات برای ژنوم انسانی است؟

(سوالات آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 89-88)

1)MODEL

2) TrEMBL

3)ExPASy

4)Ensemble

17-کدام‌یک از این بیماری‌ها را می‌توان از طریق In utero DNA Sequencing تشخیص داد؟

(سوالات آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 89-88)

1) آلزایمر                                             2) هانتینگتون

3) فیبرومیالژیا                                        4) سیستیک فیبروزیس

79-ژنومیکس ساختاری، ژنومیکس عملکردی و ژنومیکس مقایسه‌ای

18-کدام‌یک به عنوان یک منبع اطلاعاتی جامع درباره توانایی‌های متابولیکی coli است؟

(سوالات آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 89-88)

1)Biokleisli

2)OMIM

3)ExPASy

4)ECOCYC

19-در تعیین مسیرهای متابولیکی کاربرد دارد: (دکتری تخصصی (D) زیست فناوری پزشکی سال 96-95)

1) Genome sequencing

2) Genomme annotation

3) Comprative Genomics

4) Gene ontology

20-کدام‌یک از روش‌های توالی‌یابی کل ژنوم برای یوکاریوت‌های پیچیده صحت بیش‌تری دارد؟

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست فناوری پزشکی سال 96-95)

1) Hierarchical

2) shotgun

3) pyrosequencing

4) روش تجزیه شیمیایی

21-روش ارجح برای تعیین نواحی راه‌انداز و عناصر تنظیمی در ژنوم‌های نزدیک به هم:

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست فناوری پزشکی سال 96-95)

1) بررسی پروفایل‌ بیان ژنی

2) انگشت‌نگاری فیلوژنتیکی

3) Ab initio

4) موارد 2 و 3

22-کدام یک از گزینه‌های ذیل در مورد نقشه‌های ژنتیکی و فیزیکی صحیح است؟

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست فناوری پزشکی سال 96-95)

1) physical map براساس فراوانی‌های نوترکیبی ژنتیکی است.

2) physical map از دقت و Resolution بیش‌تری برخوردار است.

3) Genetic map از دقت و Resolution بیش‌تری برخوردار است.

4) Genetic map براساس DNA sequencing یا Resolution map می‌باشد.

23-برای دسترسی به اطلاعات ژن‌های انسانی و بیماری‌ها و سندرم‌های ژنتیکی کدام دیتابیس در NCBI مورد استفاده قرار می‌گیرد؟ (دکتری تخصصی (D) زیست پزشکی سامانه‌ای سال 96-95)

1) MMDB

2) DDBJ

3) OMIM

4) SRA

24-بیش‌ترین میزان اطلاعات و رشد آن مربوط به کدام گزینه است؟

(دکتری تخصصی (D) زیست پزشکی سامانه‌ای سال 96-95)

1) ساختار سه بعدی پروتئین‌ها

2) ساختار دو بعدی RNA

3) سکانس DNA

4) گلایکو و لیپو

25-پایگاه داده‌ای مناسب برای کسب اطلاعات استاندارد در مورد توضیحات عملکردی پروتئین‌ها:

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست‌فناوری پزشکی سال 97-96)

1) GO

2) PDB

3) PIR

4) PRF

26-در پیش‌بینی ژن در یوکاریوت‌ها کدام‌یک از موارد ذیل امکان پیشگوئی محاسباتی را فراهم می‌کند؟

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست‌فناوری پزشکی سال 97-96)

1) وجود اگزون‌ها و اینترون‌ها                        2) تعیین محل‌های پیرایش (Splicing)

3) وجود توالی‌های حفاظت‌شده                        4) وجود پیرایش جایگزین (Alternative splicing)

27-کدام‌یک در پیش‌بینی ژن‌های پروکاریوت‌ها کاربرد کم‌تری دارد؟

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست‌فناوری پزشکی سال 97-96)

1) مدل‌های مبتنی بر Hidden Markov

2) روش‌های مبتنی بر رونویسی

3) روش‌های مبتنی بر Homology

4) Ab-initio gene prediction

28-رویکرد بیوانفورماتیکی انتخابی در مطالعه Signaling pathway در یک سلول یوکاریوت:

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست‌فناوری پزشکی سال 97-96)

1) تعیین توالی ژنومی     2) ژنومیگس کاربردی    3) مقایسه ژنوم‌ها          4) بررسی پروفایل بیان ژنی

29-برای آنالیز داده‌های RNA-seq (تعیین توالی نسل جدید RNA) کدام‌یک از ابزارهای آنلاین زیر مناسب می‌باشد؟

(آزمون دکتری تخصصی (Ph.D) رشته زیست پزشکی سامانه‌ای سال 97-96)

1) MUMmer

2) Blast

3) Expasy

4) Galaxy

30-کدام گزینه از خصوصیات داده‌های پروژ RefSeq در پایگاه داده NCBI می‌باشد؟

(آزمون دکتری تخصصی (Ph.D) رشته زیست پزشکی سامانه‌ای سال 97-96)

1) حاوی داده‌های نرمال و غیر موتاسیون یافت می‌باشد.

2) از یک ژن چندین واریانت ژنی وجود دارد.

3) فقط داده‌های ژنومی مربوط به انسان می‌باشد.

4) حجم داده‌های آن چندین برابر GenBank می‌باشد.

80-سوالات فصل هشتم

31-از تکنیک CGH array برای چه منظوری استفاده می‌شود.

(آزمون دکتری تخصصی (Ph.D) رشته زیست پزشکی سامانه‌ای سال 97-96)

1) برای بررسی تغییرات بیان ژن‌ها در شرایط مختلف    2) برای بررسی تغییرات ژنومی نسبت به ژنوم رفرانس

3) برای بررسی تغییرات پروتئوم یک سلول یا بافت       4) برای بررسی تغییرات اپی‌ژنتیکی

32-جزایر و ترجیح کدون در ژنومیک یوکاریوت‌ها برای کدام منظور استفاده می‌شوند؟

(آزمون دکتری تخصصی (Ph.D) رشته زیست‌فناوری میکروبی سال 97-96)

1) تشخیص عملکرد ژن                               2) پیدا کردن مناطق اتصال در DNA

3) تمایز بین توالی‌های یوکاریوتی و پروکاریوتی      4) تشخیص قالب‌های خواندن باز (ORF)

81-ژنومیکس ساختاری، ژنومیکس عملکردی و ژنومیکس مقایسه‌ای

پاسخنامه کلیدی