کتاب تست بیوانفورماتیک iqb

سوالات فصل یک-بانک‌های اطلاعات اولیه

1-اگر در مطالعه‌ای هدف بررسی عملکرد یک ژن خاص باشد، کدام‌یک از شماره دسترسی‌های ذیل جهت طراحی پرایمر از بانک اطلاعاتی Refseq انتخاب ارجح می‌باشد؟ (دکتری بیوتکنولوژی پزشکی سال 1393) 1) NT-123456 2) NM-123456 3) NC-123456 4) NP-123456 2-در صورتی که هدف کلون کردن یک ژن یوکاریوت به منظور تولید یک پروتئین نوترکیب باشد کدام یک از شماره های دسترسی ذیل در انتخاب توالی مناسب از پایگاه توالی Refseq باید در نظر گرفته شود؟ (دکتری بیوتکنولوژی پزشکی[…]

1) NT-123456

2) NM-123456

3) NC-123456

4) NP-123456

2-در صورتی که هدف کلون کردن یک ژن یوکاریوت به منظور تولید یک پروتئین نوترکیب باشد کدام یک از شماره های دسترسی ذیل در انتخاب توالی مناسب از پایگاه توالی Refseq باید در نظر گرفته شود؟ (دکتری بیوتکنولوژی پزشکی سال 1392)

1) NM-123456

2) NP-123456

3) NT-123456

4) NR-123456

3-در مطالعه ای هدف شناسایی اولیه و سریع یک ژن جدید بر اساس بیان آن در یک بافت خاص می باشد. بررسی کدام‌یک بیشتر در این مورد کمک می کند؟ (دکتری بیوتکنولوژی پزشکی سال 1392)

1) پایگاه های اطلاعاتی mRNA

2) cDNA library

3) پایگاه های اطلاعاتی EST

4) پایگاه های اطلاعاتی پروتئومیک

4-کدام پایگاه داده با بقیه تناسب ندارد؟ (کنکور وزارت علوم 93 رشته بیوتکنولوژی میکروبی)

1) PDB

2) TrEMBL

3) Swiss Prot

4) Genpept

5-کدام‌یک به عنوان بانک داده‌های مربوط به DNA در ژاپن است؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 92-91)

1) PIR

2) DDBJ

3) UPR

4) ISD

6-کدام‌یک مجموعه‌ای از ارتباطات مهم بین نقشه‌های ژنتیکی، توالی‌ها، اطلاعات بیان ژن ها، ساختارها، عملکردها، موقعیت ژن‌ها و داده‌های هومولوژی را در اختیار قرار می‌دهد؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 92-91)

1) Entrez Gene

2) GenBank

3) WGS

4) EMBL

7-کدام پایگاه داده‌ها پروتئین از تلفیق چهار منبع شاملSWISS-PROT,PIRI-4, Genbank,NRL 3D تشکیل شده است؟

(آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 92-91)

1) MIPSX

2) OWL

3) NRDB

4) PDB

8-کدام پایگاه داده مربوط به پروتئین نیست؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 92-91)

1) TrEMBL

2) PIR

3) MIPS

4) DDBJ

9-کدام‌یک پایگاه داده توالی DNA متعلق به اروپاست؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 92-91)

1) EMBL

2) GenBank

3) DDBJ

4) MIPS

10-کدام پایگاه داده مربوط به اسید نوکلئیک نمی‌باشد؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 92-91

1) EMBL

2) TrEMBL

3) DDBJ

4) GenBank

8-سوالات فصل اول

11-کدام پایگاه داده‌ها تحت پوشش EBI قرار ندارد؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 92-91)

1) SWISS-PROT

2) PDB

3) NDB

4) PIR

12-کدام‌یک بانک اطلاعاتی مربوط به توالی برآورد ژنومی است؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 92-91)

1) Pat

2) GEO

3) gss

4) COG

13-کدام‌یک بر محتوای بانک اطلاعاتی gss دلالت دارد؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 91-90)

1) زیرمجموعه انسانی EST

2) توالی ژنومی با عملکرد بالا

3) توالی برآورد ژنومی

4) ژنوم‌ها و کروموزوم‌های کامل از پروژه توالی NCBI

14-کدام‌یک به عنوان خزانه اولیه توالی‌های نوکلئوتیدی است؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 91-90)

1) pat

2) htgs

3) env-nt

4) GenBank

15-کدام‌یک به عنوان پایگاه داده‌های ژن‌های انسانی و اختلال ژن‌ها است؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 91-90)

1) Swiss port

2) WGS

3) OMIM

4) nr

16-کدام‌یک به عنوان سیستم مدیریت داده‌های ژنومی است؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 91-90)

1) Spling

2) BioMart

3) GEO

4) JGI

17-کدام توضیح در مورد FASTA درست است؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 91-90)

1) ارائه کننده دقیق ساختار دوم پروتئین

2) قالبی برای جستجو در پایگاه داده‌های مربوط به توالی‌ها

3) پیش بینی کننده ساختار دوم بهینه RNA

4) قالبی برای مدل سازی مولکولی

18-کدام‌یک به عنوان بانک داده‌های مربوط به DNA در ژاپن است؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 91-90)

1) DDBJ

2) PIR

3) UPR

4) ISD

Interpro-19 محصول کدام سازمان‌هاست؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 91-90)

1) NCBI-NIH

2) SIB-EBI

3) NIH-EMBL

4) EMBL-EBI

20-یکی از جامع‌ترین سایت‌های مربوط به اطلاع‌یابی در مورد ژنوم‌های یک ارگانیزم است؟

(آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 91-90)

1) GOLD

2) Gene Cards

3) Ensemble

4) Gendb

21-کاربرد کدام‌یک فراهم آوردن مجموعه‌ای از ارتباطات مهم بین نقشه‌های ژنتیکی، توالی‌ها، اطلاعات بین ژن‌ها، ساختارها، عملکردها، موقعیت ژن‌ها و داده‌های مومولوژی است؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 90-89)

1) uniSTS

2) Entrez Gene

3) GEO

4) BLAST

22-کدام‌یک حاوی توالی‌های پروتئینی از نمونه‌های محیطی است؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 90-89)

1) nr-Env

2) env-nt

3) alu-repeats

4) month

23-کدام‌یک کاربرد OMIM را بیان می‌کند؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 90-89)

1) حاوی توالی‌های ژنومی با عملکرد بالاست که به اتمام نرسیده

2) مجموعه‌ای از توالی‌ها، ساختارها و عملکرد در ژن‌هاست

3) پایگاه داده‌های مربوط به موقعیت ژن‌ها و هومولوژی است

4) پایگاه داده‌های ژن‌های انسانی و اختلال ژن‌ها می‌باشد

24-آخرین اطلاعات عمده مربوط به توالی پروتئین در کدام بانک اطلاعاتی یافت می‌شود؟

(آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 90-89)

1) Swiss prot

2) Pat

3) PDB

4) Refseq

25-پایگاه داده‌های NR حاوی کدام‌یک نیست؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 90-89)

1) EMBL

2) PDB

3) DDBJ

4) EST

26-کدام‌یک درباره EMBL صحیح نمی‌باشد؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 90-89)

1) با Swiss prot همپوشانی دارد 2) پایگاه داده‌های مربوط به توالی نوکلئوتیدی است

3) توسط EBI ایجاد شده است 4) با nr همپوشانی دارد

27-کدام‌یک به منظور ارسال توالی‌های جدید به بانک ژن توسط پژوهشگران جهان کاربرد دارد؟

(آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 90-89)

1) MEDLINE

2) OMIM

3) BIC

4) Bankit

28-یکی از جامع‌ترین سایت‌های مربوط به اطلاع یابی در مورد ژنوم‌های یک ارگانیزم است؟

(آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 90-89)

1) GOLD

2) Gene cards

3) Ensemble

4) Gendb

9-بانک های اطلاعاتی اولیه

29-کدام‌یک بیانگر کاربرد BioMart است؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 90-89)

1) یک سیستم مدیریت داده ژنومی است

2) ابزار آنالیز داده‌های پروتئینی است

3) وب سایتی برای اطلاع‌یابی درباره ژنوم‌هاست

4) پایگاه داده‌های مربوط به ژن و پروتئین‌هاست

30-قالبی برای جستجو در پایگاه داده‌های مربوط به توالی‌هاست؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 90-89)

1) FASTA

2) EST

3) STS

4) GSS

31-از این نرم‌افزار برای مقایسه ژنوم‌ها براساس پروتئین‌هایی که آن ژنوم‌ها تولید می‌کنند استفاده می‌شود؟

(آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 90-89)

1) COG

2) SAPS

3) Taxplot

4) Splign

32-کدام‌یک جزء خدمات قابل ارائه EBI نیست؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 90-89)

1) Grouping

2) FTP Archives

3) Research & Development

4) Database submission

33-کدام بانک اطلاعاتی در اروپا با GenBANK هم‌طراز بوده و با آن در تعامل می‌باشد؟

(سوالات آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 89-88)

1) EBI

2) EMBL

3) DDBJ

4) CIB

34-کدام‌یک پل ارتباطی میان پایگاه داده‌های بیولوژیک مولکولی با پایگاه‌های درمانی است؟

(سوالات آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 89-88)

1) OMIM

2) SRS

3) PDB

4) SCOP

35-کدام‌یک توسط NCBI مدیریت می‌شود؟ (سوالات آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 89-88)

1) SRS

2) GenBANK

3) Swiss-port

4) PDB

36-پایگاه داده‌های ساختاری کمبریج مشتمل بر چه نوع داده‌هایی است؟ (سوالات آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 89-88)

1) ماکرومولکول‌ها 2) پروتئین‌ها

3) ژن‌ها 4) مولکول‌هایی کمتر از 100 اتم

37-بهترین گزینه برای جستجوی ساختمان اول پروتئین‌ها کدام است؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 88-87)

1) Uniport

2) PDB

3) PFAM

4) STRIDE

38-پایگاه داده‌های ذیل همگی پایگاه توالی نوکلئوتیدی هستند، بجز: (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 88-87)

1) EMBL

2) PIR

3) DDBJ

4) GenBank

39-طبقه‌بندی در کدام پایگاه اطلاعات کاملا به صورت خودکار (اتوماتیک) صورت می‌گیرد؟

(آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 88-87)

1) FSSP

2) SCOP

3) CATH

4) HOMSTRAD

40-داده پایگاه‌های اولیه پروتئینی (نوع اول) شامل همه موارد زیر است، بجز: (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 88-87)

1) SWISS-PROT

2) EMBL

3) TrEMBL

4) PIR

41-پایگاه داده Swiss Prot وابسته به ………….. سوئیس می‌باشد. (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 88-87)

1) موسسه بیوانفورماتیک 2) انجمن پروتئومیکس

3) موسسه بیوتکنولوژی 4) انجمن بیوشیمی

42-کدام‌یک از موارد ذیل به عنوان یک پایگاه داده اولیه محسوب می‌شود؟ (دکتری تخصصی (D) زیست فناوری پزشکی سال 96-95)

1) OMIM

2) Refseq

3) Uniparc

4) UniGene

43-کدام‌یک از سیستم‌های بازیابی برای پایگاه‌های داده‌های بیولوژیک (Retrieval System) از جامعیت بیش‌تری برخوردار است؟ (دکتری تخصصی (D) زیست فناوری پزشکی سال 96-95)

1) SRS

2) Entrez

3) NCBI

4) DBGET

44-کدام‌یک از شماره دسترسی (Accession Number)های زیر می‌تواند مربوط به یک توالی mRNA رفرانس (RefSeq) در دیتابیس NCBI باشد؟ (دکتری تخصصی (D) زیست پزشکی سامانه‌ای سال 96-95)

1) AC-3564.2

2) NP-43321.1

3) AA2236.2

4) NM-43225.1

10-سوالات فصل اول

45-پایگاه داده پروتئینی Uniprot در سال 2002 از ادغام کدام دیتابیس‌ها ایجاد شد؟

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست پزشکی سامانه‌ای سال 96-95)

1) PIR, EMBL, SWISS- Prot

2) PIR, ResSeq, TrEMBL

3) TrEMBL, PIR, SWISS- Prot

4) TrEMBL, RefSeq, PIR

46-سه قسمت اصلی محتوای داده در GenBank کدام گزینه زیر می‌باشد؟

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست پزشکی سامانه‌ای سال 96-95)

1) Nucleotide, Gene, Genome

2) Nucleotide, GSS, STS

3) EST, GSS, Gene

4) EST, GSS, Nucleotide

47-برای تثبیت (submit) کردن یک توالی DNA در پایگاه داده NCBI از کدام نرم‌افزار زیر استفاده می‌شود؟

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست پزشکی سامانه‌ای سال 96-95)

1) BioEdit

2) Chromas

3) Sequin

4) Finch TV

48-بیش‌ترین میزان Taxa موجود در GenBank مربوط به کدام دسته زیر است؟

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست پزشکی سامانه‌ای سال 96-95)

1) Archaea(4 Bacteria(3 Eukaryota(2 Fungi

UniGene-49 زیرمجموعه کدام‌یک از پایگاه‌های ذیل محسوب می‌شود؟ (دکتری تخصصی (D) زیست‌فناوری پزشکی سال 97-96)

1) EST(4 SNP(3 SRA(2 GSS

50-کدام‌یک از گزینه‌ها جزء پایگاه داده‌های اولیه (Primary database) به شمار می‌رود؟