کتاب تست بیوانفورماتیک iqb

سوالات فصل دهم-تجزیه و تحلیل‌های فیلوژنی کتاب تست بیوانفورماتیک

1-بر طبق فرضیه ساعت مولکولی:(کنکور دکتری وزارت علوم 93 بیوتکنولوژی میکروبی) 1) همه پروتئین‌ها با نرخ ثابت یکسان تغییر می‌کنند. 2) همه پروتئین‌ها با نرخی تغییر می‌کنند که با سوابق فسیلی سازگار است. 3) برای هر پروتئین معین، نرخ تغییرات مولکولی به تدریج کم می‌شوند. 4) برای هر پروتئین معین، نرخ تغییرات مولکولی تقریبا در هر رده تکاملی ثابت است. 2-ترتیبی که بر اساس آن در برنامه Clustal، توالی‌ها به هم‌ردیفی چندگانه اضافه می‌شوند. بر چه مبنایی[…]

1-بر طبق فرضیه ساعت مولکولی:(کنکور دکتری وزارت علوم 93 بیوتکنولوژی میکروبی)

1) همه پروتئین‌ها با نرخ ثابت یکسان تغییر می‌کنند.

2) همه پروتئین‌ها با نرخی تغییر می‌کنند که با سوابق فسیلی سازگار است.

3) برای هر پروتئین معین، نرخ تغییرات مولکولی به تدریج کم می‌شوند.

4) برای هر پروتئین معین، نرخ تغییرات مولکولی تقریبا در هر رده تکاملی ثابت است.

2-ترتیبی که بر اساس آن در برنامه Clustal، توالی‌ها به هم‌ردیفی چندگانه اضافه می‌شوند. بر چه مبنایی تعیین می‌شود؟

(کنکور دکتری وزارت علوم 93 بیوتکنولوژی میکروبی)

1) درصد یکسانی توالی‌ها

2) درخت فیلوژنتیک

3) ترتیب وارد شدن توالی‌ها در برنامه‌ها

4) ارگانیسم‌هایی که توالی‌ها از آن‌ها به دست آمده‌اند.

3-کدام تعریف در مورد توالی های ارتولوگ درست است؟ (کنکور وزارت علوم 93 رشته بیوتکنولوژی میکروبی)

1) توالی‌های همولوگ در یک گونه که مشابه بوده و عملکرد یکسانی دارند.

2) توالی‌های همولوگ در یک گونه، که حاصل دو برابر شدن ژن‌ها هستند.

3) توالی‌های همولوگ در گونه‌های مختلف، که از ژن اجدادی مشترک حاصل شده‌اند.

4) توالی‌های همولوگ که شباهت آمینواسید کم، اما شباهت ساختمانی زیاد دارند.

4-کدام‌یک از روش‌های ترسیم درخت فیلوژنتیکی در گروه روش‌های Character based قرار می‌گیرد؟

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست پزشکی سامانه‌ای سال 96-95)

1) UPGMA

2) Neighbor- joining

3) Maximum parsimony

4) Bootstrap

5-برای بررسی روابط تکاملی با استفاده از درخت‌های فیلوژنتیکی استفاده از چه نوع ماکرومولکولی اطلاعات بیش‌تری به ما می‌دهد؟ (دکتری تخصصی (D) زیست پزشکی سامانه‌ای سال 96-95)

1) توالی‌های پروتئینی

2) ساختار پروتئین

3) توالی‌های mRNA

4) توالی DNA

123-تجزیه و تحلیل‌های فیلوژنی

6-چنانچه توالی آلفاهموگلوبین موش را با آلفاهموگلوبین انسان مقایسه کنیم. بیش از 60 درصد شباهت دارند، بنابراین این دو پروتئین نسبت به هم ……….. . (دکتری تخصصی (D) زیست پزشکی سامانه‌ای سال 96-95)

1) پارالوگ هستند. 2) زنولوگ هستند.

3) ارتولوگ هستند. 4) آنالوگ هستند.

7-مناسب‌ترین روش برای ارزیابی صحت و دقت یک درخت فیلوژنتیکی ترسیم شده کدام می‌باشد؟

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست پزشکی سامانه‌ای سال 96-95)

1) استفاده از روش‌های مختلف هم‌ترازی 2) استفاده از روش Bootstrap

3) تکرار کردن روش ترسیم درخت 4) تقسیم کردن توالی‌ها به چند بخش

8-خروجی کدام‌یک از روش‌های ترسیم درخت فیلوژنتیک درخت بدون ریشه (Unroted tree) می‌باشد؟

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست پزشکی سامانه‌ای سال 96-95)

1) Neighbor- joining (NJ)

2) UPGMA

3) PHYLIP

4) PAUP

9-کدام‌یک از نرم‌افزارهای زیر برای ترسیم درخت فیلوژنتیکی استفاده می‌شود؟

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست پزشکی سامانه‌ای سال 96-95)

1) Jalview

2) Dotmatcher

3) Chromas

4) MEGA

10-دو خصوصیت اصلی هر درخت فیلوژنتیکی ترسیم شده در بررسی روابط تکاملی کدام می‌باشد؟

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست پزشکی سامانه‌ای سال 96-95)

1) تعداد گره (node) و تعداد Cladeها 2) توپولوژی و طول شاخه‌های درخت

3) وجود ریشه (root) و تعداد Cladeها 4) وجود ریشه (root) و توپولوژی درخت

11-کدام یک از گزینه‌های زیر جزء مدل‌های جایگزینی جهت استخراج ماتریس فاصله در ترسیم درخت‌های فیلوژنتیک می‌باشد؟ (دکتری تخصصی (D) زیست پزشکی سامانه‌ای سال 96-95)

1) DiAlign

2) Kimura

3) Bootstrap

4) T- coffee

12-برای ارزیابی درخت فیلوژنیکی ترسیم شده از چه روشی می‌توان استفاده نمود؟