1-کدام‌یک از ابزارهای ذیل در تشخیص تغییرات پس از ترجمه در آنالیزهای پروتئولیتیک کاربردی ندارد؟

(دکتری تخصصی زیست فناوری پزشکی 95-94)

1) Find Mod

2) Glyco Mod

3) SesID

4) Signal P

2-پایگاه اطلاعاتی مناسب برای بررسی واکنش‌های پروتئین- پروتئین: (دکتری تخصصی زیست فناوری پزشکی 95-94)

1) STRING

2) PDB

3) SCOP

4) CATH

3-کاربرد بیوانفورماتیکی مفهوم Rosetta Stone Sequence در چیست؟ (دکتری تخصصی زیست فناوری پزشکی 95-94)

1) تشخیص تغییرات بعد از ترجمه در آنالیز پروتئولیتیک

2) پیش‌بینی پل‌های دی‌سولفیدی

3) پیش‌بینی میان کنش‌های پروتئین- پروتئین

4) تفسیر Protein Microarray

4-کدام‌یک از روش‌های محاسباتی (Computational) در مهندسی آنزیم‌ها از اهمیت و پیشرفت سریع‌تری برخوردار بوده است؟ (دکتری تخصصی زیست فناوری پزشکی 95-94)

1) روش‌های بیوانفورماتیکی

2) Molecular modeling

3) de novo design

4) Structural analysis

5-مقایسه تنوع در الگوی پروتئینی سلولی تحت تاثیر یک هورمون خاص از اهداف کدام‌یک از انواع پروتئومیکس می‌باشد؟

(دکتری بیوتکنولوژی پزشکی سال 1393)

1) Structural Proteomics

2) Functional Proteomics

3) Profiling Proteomics

4) 1 و 3

6-در مطالعات پیش گوئی واکنش بین دو پروتئین، منظور از اینترلوگ پروتئین هایی هستند که:

(دکتری بیوتکنولوژی پزشکی سال 1392)

1) ژن‌های آنها همسایه باشند                          2) ژن‌های آن‌ها ترکیب شده اند

3) شباهت ساختمانی داشته اند                         4) همولوگ در دو پروتئم باشند

7. کدام‌یک بیانگر الگوریتم جستجوی اسپکترومی جرمی باز است؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 92-91)

1) OMSSA              2)OISD                   3)MASON               4)OMSF

8-کدام استاندارد مربوط به نمایش داده‌های پروتئومیکس از حیث تسهیل مقایسه و تبادل داده‌هاست؟

(آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 91-90)

1)KEGG

2)SBML

3) OBO

4)HUPO

51-پروتئومیکس

9-کدام‌یک به عنوان یک موتور جستجوی کارآمد برای پیداکردن طیف پپتیدی MS/MS است؟

(آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 90-89)

1)OMSSA

2) Spidey

3) COG

4)Ensemble

10-کدام‌یک در مورد OMSSA درست است؟ (سوالات آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 89-88)

1) یک بانک اطلاعاتی مربوط به پپتیدهاست که امکان آنالیز آماری را فراهم می‌کند

2) روش اسپکترومتری جرمی باز مبتنی بر آنالیز آماری است

3) یک موتور جستجوی کارامد برای یافتن طیف پپتیدی Ms/Ms با طول معلوم است

4) ابزار آنالیز داده‌های مربوط به نوکلئوتیدها و ژن‌هاست

11-روش Yeast Two Hybrid به چه منظور استفاده می‌شود؟

(آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 88-87)

1) بررسی پروتئین‌های موجود در مخمر              2) استخراج توالی پروتئین

3) بررسی بر هم کنش پروتئین- پروتئین              4) بررسی ساختمان دوم پروتئین

12-عبارت صحیح را مشخص نمائید. (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 88-87)

1) ژنوم و پروتئوم ثابت از ویژگی‌های یک موجود زنده محسوب می‌شوند.

2) ژنوم و پروتئوم متغیر از ویژگی‌های یک موجود زنده محسوب می‌شوند.

3) ژنوم ثابت و پروتئوم متغیر از ویژگی‌های یک موجود زنده محسوب می‌شوند.

4) ژنوم متغیر و پروتئوم ثابت از ویژگی‌های یک موجود زنده محسوب می‌شوند.

13-کاربرد کدام‌یک از موارد زیر در پرونئومیکس متداول است؟ (آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 88-87)

1) Size-Exclusion chromatography- Ion Trap-ESI

2) Protein Database search-ESO- IR

3) Gel Image Analysis –IR

4)Peptide Mass Map Analysis-MALDI-CD

14-کدام‌یک از سازمان‌های زیر بیش‌ترین ارتباط را با پروتئومیکس دارا می‌باشند؟

(آزمون دکتری پروتئومیکس سال تحصیلی 88-87)

1) Protein Society

2) Biophysical Society

3) HUPO

4) European Bioinformatics Institute

15-در طبقه‌بندی پروتئین‌ها کدام گروه از پایگاه‌های داده‌ای ذیل براساس شباهت‌های کلی توالی پروتئینی می‌باشند؟

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست‌فناوری پزشکی سال 97-96)

1) COG و ProtoNet

2) COG و Pfam

3) ProtoNet و Pfam

4) ProtoNet و PRINTS

16-روش پروتئومیکس پیشنهادی در مورد علت‌یابی یک بیماری عضلانی …………… است.

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست‌فناوری پزشکی سال 97-96)

1) طیف‌سنجی جرمی (MS)                       2) روش دوهیبریدی مخمر (Yeast two-hybrid method)

3) الکتروفورز درون‌ ژلی تفریقی (DIGE)           4) روش Rosetta Stone

17-پایگاه داده‌ای مناسب برای جستجوی نتایج طیف‌سنجی جرمی (MS):

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست‌فناوری پزشکی سال 97-96)

1) RESID

2) TargetP

3) PSORT

4) ProFound

18-در پیش‌بینی برهم‌کنش پروتئین‌ها کدام‌یک از موارد ذیل کم‌تر کاربرد دارد؟

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست‌فناوری پزشکی سال 97-96)

1) مطالعات تکاملی توالی‌های ژنی

2) الگوهای مبتنی بر انطباق چندگانه توالی‌ها

3) الگوهای پیوستگی ژنی

4) الگوهای هم‌جوشی ژنی (Gene fusion proteins)

Protein signature-19 عبارت است از:

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست‌فناوری پزشکی سال 97-96)

1) مسیری که یک پروتئین بعد از سنتز در هسته طی می‌کند.

2) مسیری که پروتئین در سیتوپلاسم طی می‌کند.

3) پروتئینی که در سطح سلول بیان می‌شود.

4) تعدادی پروتئین خاص (unique) با ویژگی‌های مشترک.

52-سوالات فصل سوم

20-مکان‌یابی سلولی پروتئین‌ها توسط کدام‌یک از ابزارهای بیوانفورماتیکی ذیل امکان‌پذیر است؟

(دکتری تخصصی (Ph.D) زیست‌فناوری پزشکی سال 97-96)

1) Target P

2) Proufound

3) Expasy

4) MASCOT

53-پروتئومیکس